1) Зачет оплаты в выпуске продукции.

 Если Вы используете документ "Выпуск продукции" с видом операции "Поступление из переработки" , то можно сделать зачет ранее сделанных платежей производителю. 

В результате это отражается в ведомости расчетов с поставщиками. 

Причем зачет оплаты работает как для предоплаты, так и для постоплаты. Это показывает следующий скриншот.

2) Подбор номенклатуры в документе "Передача сырья в переработку" 

3) Групповое создание документов "Выпуск продукции" 

Подробнее с механизмом Вы можете ознакомиться по ссылке 

4) Ввод "Выпуск продукции" на основании "Заказ клиента".

Если Вы хотите сократить путь от заказа клиента до отражения выпуска продукции и при этом видеть связь выпуска с заказом. 

5) Изменять статус "Заказ в производство".

Теперь Вы можете менять статус документов "Заказ в производство". Подробнее об этом по ссылке на сайте. 

6) В спецификации указывать вид времени продолжительности операции.

Ранее такая возможность была реализована только в документе "Заказ в производство"

7) Готовность работы с 1С:УТ ред. 11.5.12.135